据悉，三沙中心渔港工程作为霞浦台水中心的重要配套项目，被列入2010年福建省在建重点，得到了国家农业部及省、市、县相关部门的大力支持。该工程于2009年7月经国家农业部立项，立项总投资7136万元，其中：国家投资2900万元，省级配套2900万元。国家农业部于2010年8月批复了工程初步设计，工程建设期为24个月，规划为“一港两址”，即：在三沙五澳港建设物流港区，田澳港建设避风港区。
中心渔港建成后，将集两岸渔船停泊、装卸作业、鱼货冷藏加工、交易流通、管理服务、对台商贸旅游和船只避风等多功能为一体，可形成避风水域69.8公顷，提供约600艘中型渔船避风及防御13级台风。对有效解决霞浦台水中心的工、贸物流配套，进一步发挥三沙口岸对台优势，提升港区商贸物流、旅游、渔业产业化发展和防灾减灾水平等，都具有极其重要的意义。